Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV89

SH2D5, SH2 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D5Q6ZV89 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH2D5Q6ZV89 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D5Q6ZV89 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms