Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms