Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC9Q6ZRR7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms