Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms