Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBR1LQ6UX01 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms