Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms