Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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