Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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USP17L2Q6R6M4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L2Q6R6M4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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