Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms