Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms