Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms