Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms