Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms