Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM29Q5VYK3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms