Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 816.5 ms