Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q5VSD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms