Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDSS1Q5T2R2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms