Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP170Q5SW79 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP170Q5SW79 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms