Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A3Q5K4L6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms