Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEP78Q5JTW2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP78Q5JTW2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms