Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms