Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LONRF3Q496Y0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LONRF3Q496Y0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms