Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-BQ31612 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-BQ31612 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms