Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYSND1Q2T9J0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms