Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC96Q2M329 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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