Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC27Q2M243 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC27Q2M243 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms