Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIDA1Q1XH10 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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