Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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