Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPROQ16827 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPROQ16827 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPROQ16827 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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