Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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