Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NDUFA9Q16795 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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NDUFA9Q16795 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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