Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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FOXD1Q16676 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
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FOXD1Q16676 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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FOXD1Q16676 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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FOXD1Q16676 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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FOXD1Q16676 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
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FOXD1Q16676 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXD1Q16676 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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FOXD1Q16676 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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FOXD1Q16676 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXD1Q16676 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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