Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLFQ16534 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLFQ16534 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLFQ16534 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLFQ16534 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms