Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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SSX1Q16384 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SSX1Q16384 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SSX1Q16384 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SSX1Q16384 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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