Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms