Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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