Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRRQ15256 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms