Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME4Q14997 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms