Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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CHD4Q14839 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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CHD4Q14839 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD4Q14839 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD4Q14839 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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