Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PMS2P11Q13670 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PMS2P11Q13670 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PMS2P11Q13670 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PMS2P11Q13670 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PMS2P11Q13670 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PMS2P11Q13670 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PMS2P11Q13670 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PMS2P11Q13670 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P11Q13670 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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