Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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