Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms