Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BFSP2Q13515 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms