Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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