Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SELENBP1Q13228 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SELENBP1Q13228 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms