Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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