Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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