Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF2Q12933 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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