Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms