Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms